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      產品線類別
      10x Genomics 產品
      Chromium 單細胞基因表達
      時間:2024-11-22點擊:8472

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      Resources:     獲取報價                      觀看工作原理                    下載產品說明                 經費申請寫作協(xié)助                     單細胞購買指南

       

      Chromium單細胞基因表達解決方案能夠提供單細胞轉錄組3'基因表達和多組學功能,可同時對成千上萬個細胞進行分析。通過結合單細胞水平的基因表達、細胞表面蛋白表達或CRISPR編輯,可以探索細胞異質性,鑒定新的靶點及生物標志物。


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      高通量單細胞分析

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      多組學細胞讀數

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      可擴展的功能基因組學

      捕獲樣本中成千上萬個細胞的完整異質性。

      可檢測3’ mRNA、細胞表面蛋白、CRISPR擾動及其他。

      通過配對的CRISPR敲除和全轉錄組讀數來探索基因網絡。

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      簡化的數據分析

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      為期一天的實驗室流程

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      兼容不同的樣本

      使用易用的軟件來探索和解釋單細胞基因表達譜。在一天之內完成從樣本到可測序文庫的過程。經驗證適用于固定、新鮮和冷凍的樣本,以及完整的細胞和細胞核。


      通過單細胞多組學探索您的應用



      靈活的解決方案 滿足您各種需求

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      單細胞基因表達的標準


      Chromium單細胞基因表達解決方案可以滿足您的各種需求--從處理大型項目到發(fā)現基因表達的多樣性,逐個細胞地進行解析。


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      獲得初步見解

      開啟您的單細胞基因表達實驗--使用可以負擔的適用于小型項目的解決方案進行試點研究或優(yōu)化實驗條件。

      單細胞基因表達低通量解決方案

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      開啟您的單細胞發(fā)現之旅。僅需100-1,000個細胞即可進行試點研究,啟動初步研究或進行樣本制備優(yōu)化。
      觀看產品網絡研討會 >


      獲得初步見解


      優(yōu)化樣本制備


      從樣本制備到數據分析的全面支持

      通過小規(guī)模研究,從100-1,000個細胞中找到可揭示的內容。


      優(yōu)化實驗條件,提高您的研究成功率。

      從技術資源到用戶友好的基于云的數據分析都將為您提供端到端的支持。





      多組學分析

      同時測量細胞表面蛋白表達或CRISPR擾動與基因表達。

      CRISPR篩選                                                     2.png

      通過對細胞內sgRNA的直接捕獲和基因表達的變化,以單細胞分辨率評估CRISPR擾動帶來的影響。

      查看信息圖 >
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      • 篩選與疾病相關的新型基因靶點或耐藥性的驅動因素

      • 通過更快的流程和更高的分辨率開展功能性遺傳篩選

      • 揭示發(fā)育過程中復雜的基因調控通路

      觀看CRISPR網絡研討會 >


      細胞表面蛋白
       

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      綜合分析單細胞的基因和蛋白表達,以便發(fā)現新的細胞亞群和罕見的細胞群體。

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      • 通過額外的蛋白信息來豐富對不同細胞表型的認識

      • 通過同步的單細胞檢測來探索轉錄組與蛋白組之間的關系

      下載應用指南 >







      單細胞基因表達Flex

      Chromium單細胞基因表達Flex能夠提供單細胞基因表達和混樣功能,以分析數百到一百萬個細胞。在樣本采集點進行固定可保留脆弱樣本的生物學特征,并大大簡化工作流程,帶來更多樣本的生物學見解。

      觀看相關網絡研討會 >   

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      自動化工作流程

      通過Chromium Connect 單細胞基因表達解決方案獲得一致性高、重復性好的結果,大大提高實驗室生產力。

      自動化單細胞基因表達解決方案

      基于Chromium Connect的自動化基因表達工作流程,助力您探索異質性,發(fā)現新的目標和生物標志物,并以提高生產力來揭示復雜的細胞過程。2.png


      優(yōu)化生產力

      將您的工作流程標準化

      流線操作

      縮短手動操作時間,從單細胞到可以測序的基因表達文庫,實現無人值守的便捷。

      在多個實驗室、用戶、甚至多個站點生成一致且可重復的單細胞基因表達結果。

      采用預先分裝的自動化專屬試劑,這些試劑采用顏色編碼和2D條形碼,用于防錯試劑跟蹤和加載。


      完整的解決方案

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      基于Next GEM技術的Chromium儀器

          Chromium X Series

          通量靈活、可拓展

          Chromium Controller

          小巧靈活

          Chromium Connect

          自動化


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         Chromium單細胞基因表達試劑

         利用我們的試劑盒,您可以捕獲和擴增3’

         mRNA,鑒定CRISPR擾動或開展其他應用。


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           分析和可視化軟件

              

               Cell Ranger

               數據分析流程

               Loupe Browser

               數據可視化軟件


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        世界級的技術支持和客戶支持


        您可以通過電話或電子郵件聯(lián)系我們的 專家支持團隊。


      工作流程

      單細胞基因表達的基本工作流程如下所示。若您使用我們的Feature Barcode試劑盒來分析CRISPR或細胞表面蛋白,我們將會提供其他方案用于修飾您感興趣的蛋白。




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      樣本制備


      從成百上千個細胞開始。按照洗滌、計數和濃縮細胞的高效做法,盡量減少細胞團塊的存在,回收高質量的單細胞懸液。



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      文庫構建


      利用我們的試劑盒和Chromium Controller構建帶有10x條形碼的文庫。 Chromium Controller將每個帶有10x條形碼的凝膠珠的細胞封裝在單個液滴中。在每個納升級的液滴中,細胞經過逆轉錄生成cDNA,其中單個細胞的所有cDNA都帶有共同的10x條形碼。




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      測序


      第2步所生成的10x條形碼文庫與Illumina測序儀上的標準短讀長NGS測序兼容,能夠實現數千個單細胞的大規(guī)模轉錄分析。


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      據分析


      我們的Cell Ranger分析軟件可生成每個細胞的表達譜,鑒定表達譜相似的細胞簇,還能夠對多個樣本的數據進行合并分析。


      分析流程輸出

      輸出結果包括質控信息和文件,這些文件可輕松用于Loupe可視化軟件或第三方R工具及Python工具的進一步分析。



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      數據可視化


      利用我們的Loupe Browser可視化軟件,您可以交互式地探索實驗結果,研究目的基因的表達模式,確定細胞類型,并開展細胞簇和樣本之間的比較分析。


      只有生物信息專家才能使用嗎?

      Loupe是點選式軟件,任何人都可以輕松下載和使用。






      常 見 問 題

      • Chromium單細胞基因表達能夠實現哪種分析?

        它提供了一種全面的方法,來分析基因表達(全轉錄組或靶向),以及細胞表面蛋白或CRISPR編輯對復雜生物學的多維見解。

      • 能夠分析哪些類型的RNA?

        只要是表達聚腺苷酸化mRNA分子的細胞類型,都與該單細胞RNA-seq流程兼容。

      • 與哪些類型的樣本兼容?

        Chromium單細胞基因表達與新鮮、固定(甲醇)和冷凍的單細胞或單細胞核懸液兼容。兼容的物種包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。

      • 如何分析我的單細胞數據?

        10x Genomics提供了兩種類型的軟件,可幫助您分析數據:Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger這款分析軟件能夠自動生成每個細胞的表達譜,并鑒定表達譜相似的細胞簇。隨后,您可以利用Loupe Browser可視化軟件來交互式地探索實驗結果。您可以從10x支持網站上免費下載Cell Ranger和Loupe Browser。

      • 細胞大小是否存在限制?

        我們在內部測試了直徑達到30微米的細胞。此外,許多客戶文獻也成功證明了對各類細胞的兼容性,如肝細胞、成纖維細胞和心肌細胞,它們的大小往往超過30微米。


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        產品


       單細胞基因表達


       

         單細胞免疫分析

       

         空間基因表達

       

         單細胞ATAC

        性能
      •   3’轉錄組基因在組織中的表達

      •   靶向基因表達

      •   多樣本混合檢測

      •   全長配對的TCR/BCR序列

      •   5’全轉錄組基因表達

      •   靶向基因表達

      •   3’轉錄組基因在組織中的表達

      •   靶向基因表達

      •   兼容FFPE組織切片和新鮮冷凍組織切片

      •   通過開放染色質分析進行表觀基因組學研究

        擴展應用
      •   細胞表面蛋白

      •   CRISPR篩選

      •   多樣本混合檢測

      •   細胞表面蛋白

      •   抗原特異性

      •   CRISPR篩選

      •   免疫熒光蛋白共檢測

      •   –

        儀器
      •   Chromium X系列單細胞系統(tǒng)

      •   Chromium Controller

      •   Chromium Connect

      •   Chromium X系列單細胞系統(tǒng)

      •   Chromium Controller

      •   Chromium Connect

      •    Visium CytAssist

      •   Chromium X系列單細胞系統(tǒng)

      •   Chromium Controller

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      友情鏈接:      10x Genomics官網                    10x單細胞基因表達                     10x技術支持                     10x視頻中心

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