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      Products
      產(chǎn)品線類別
      10x Genomics 產(chǎn)品
      Chromium 單細(xì)胞基因表達(dá)
      時(shí)間:2024-11-22點(diǎn)擊:8431

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      Resources:     獲取報(bào)價(jià)                      觀看工作原理                    下載產(chǎn)品說明                 經(jīng)費(fèi)申請寫作協(xié)助                     單細(xì)胞購買指南

       

      Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案能夠提供單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組3'基因表達(dá)和多組學(xué)功能,可同時(shí)對成千上萬個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分析。通過結(jié)合單細(xì)胞水平的基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)或CRISPR編輯,可以探索細(xì)胞異質(zhì)性,鑒定新的靶點(diǎn)及生物標(biāo)志物。


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      高通量單細(xì)胞分析

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      多組學(xué)細(xì)胞讀數(shù)

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      可擴(kuò)展的功能基因組學(xué)

      捕獲樣本中成千上萬個(gè)細(xì)胞的完整異質(zhì)性。

      可檢測3’ mRNA、細(xì)胞表面蛋白、CRISPR擾動(dòng)及其他。

      通過配對的CRISPR敲除和全轉(zhuǎn)錄組讀數(shù)來探索基因網(wǎng)絡(luò)。

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      簡化的數(shù)據(jù)分析

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      為期一天的實(shí)驗(yàn)室流程

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      兼容不同的樣本

      使用易用的軟件來探索和解釋單細(xì)胞基因表達(dá)譜。在一天之內(nèi)完成從樣本到可測序文庫的過程。經(jīng)驗(yàn)證適用于固定、新鮮和冷凍的樣本,以及完整的細(xì)胞和細(xì)胞核。


      通過單細(xì)胞多組學(xué)探索您的應(yīng)用



      靈活的解決方案 滿足您各種需求

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      單細(xì)胞基因表達(dá)的標(biāo)準(zhǔn)


      Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案可以滿足您的各種需求--從處理大型項(xiàng)目到發(fā)現(xiàn)基因表達(dá)的多樣性,逐個(gè)細(xì)胞地進(jìn)行解析。


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      獲得初步見解

      開啟您的單細(xì)胞基因表達(dá)實(shí)驗(yàn)--使用可以負(fù)擔(dān)的適用于小型項(xiàng)目的解決方案進(jìn)行試點(diǎn)研究或優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件。

      單細(xì)胞基因表達(dá)低通量解決方案

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      開啟您的單細(xì)胞發(fā)現(xiàn)之旅。僅需100-1,000個(gè)細(xì)胞即可進(jìn)行試點(diǎn)研究,啟動(dòng)初步研究或進(jìn)行樣本制備優(yōu)化。
      觀看產(chǎn)品網(wǎng)絡(luò)研討會(huì) >


      獲得初步見解


      優(yōu)化樣本制備


      從樣本制備到數(shù)據(jù)分析的全面支持

      通過小規(guī)模研究,從100-1,000個(gè)細(xì)胞中找到可揭示的內(nèi)容。


      優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件,提高您的研究成功率。

      從技術(shù)資源到用戶友好的基于云的數(shù)據(jù)分析都將為您提供端到端的支持。





      多組學(xué)分析

      同時(shí)測量細(xì)胞表面蛋白表達(dá)或CRISPR擾動(dòng)與基因表達(dá)。

      CRISPR篩選                                                     2.png

      通過對細(xì)胞內(nèi)sgRNA的直接捕獲和基因表達(dá)的變化,以單細(xì)胞分辨率評估CRISPR擾動(dòng)帶來的影響。

      查看信息圖 >
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      • 篩選與疾病相關(guān)的新型基因靶點(diǎn)或耐藥性的驅(qū)動(dòng)因素

      • 通過更快的流程和更高的分辨率開展功能性遺傳篩選

      • 揭示發(fā)育過程中復(fù)雜的基因調(diào)控通路

      觀看CRISPR網(wǎng)絡(luò)研討會(huì) >


      細(xì)胞表面蛋白
       

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      綜合分析單細(xì)胞的基因和蛋白表達(dá),以便發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞亞群和罕見的細(xì)胞群體。

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      • 通過額外的蛋白信息來豐富對不同細(xì)胞表型的認(rèn)識(shí)

      • 通過同步的單細(xì)胞檢測來探索轉(zhuǎn)錄組與蛋白組之間的關(guān)系

      下載應(yīng)用指南 >







      單細(xì)胞基因表達(dá)Flex

      Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)Flex能夠提供單細(xì)胞基因表達(dá)和混樣功能,以分析數(shù)百到一百萬個(gè)細(xì)胞。在樣本采集點(diǎn)進(jìn)行固定可保留脆弱樣本的生物學(xué)特征,并大大簡化工作流程,帶來更多樣本的生物學(xué)見解。

      觀看相關(guān)網(wǎng)絡(luò)研討會(huì) >   

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      自動(dòng)化工作流程

      通過Chromium Connect 單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案獲得一致性高、重復(fù)性好的結(jié)果,大大提高實(shí)驗(yàn)室生產(chǎn)力。

      自動(dòng)化單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案

      基于Chromium Connect的自動(dòng)化基因表達(dá)工作流程,助力您探索異質(zhì)性,發(fā)現(xiàn)新的目標(biāo)和生物標(biāo)志物,并以提高生產(chǎn)力來揭示復(fù)雜的細(xì)胞過程。2.png


      優(yōu)化生產(chǎn)力

      將您的工作流程標(biāo)準(zhǔn)化

      流線操作

      縮短手動(dòng)操作時(shí)間,從單細(xì)胞到可以測序的基因表達(dá)文庫,實(shí)現(xiàn)無人值守的便捷。

      在多個(gè)實(shí)驗(yàn)室、用戶、甚至多個(gè)站點(diǎn)生成一致且可重復(fù)的單細(xì)胞基因表達(dá)結(jié)果。

      采用預(yù)先分裝的自動(dòng)化專屬試劑,這些試劑采用顏色編碼和2D條形碼,用于防錯(cuò)試劑跟蹤和加載。


      完整的解決方案

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      基于Next GEM技術(shù)的Chromium儀器

          Chromium X Series

          通量靈活、可拓展

          Chromium Controller

          小巧靈活

          Chromium Connect

          自動(dòng)化


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         Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)試劑

         利用我們的試劑盒,您可以捕獲和擴(kuò)增3’

         mRNA,鑒定CRISPR擾動(dòng)或開展其他應(yīng)用。


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           分析和可視化軟件

              

               Cell Ranger

               數(shù)據(jù)分析流程

               Loupe Browser

               數(shù)據(jù)可視化軟件


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        世界級(jí)的技術(shù)支持和客戶支持


        您可以通過電話或電子郵件聯(lián)系我們的 專家支持團(tuán)隊(duì)。


      工作流程

      單細(xì)胞基因表達(dá)的基本工作流程如下所示。若您使用我們的Feature Barcode試劑盒來分析CRISPR或細(xì)胞表面蛋白,我們將會(huì)提供其他方案用于修飾您感興趣的蛋白。




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      樣本制備


      從成百上千個(gè)細(xì)胞開始。按照洗滌、計(jì)數(shù)和濃縮細(xì)胞的高效做法,盡量減少細(xì)胞團(tuán)塊的存在,回收高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液。



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      文庫構(gòu)建


      利用我們的試劑盒和Chromium Controller構(gòu)建帶有10x條形碼的文庫。 Chromium Controller將每個(gè)帶有10x條形碼的凝膠珠的細(xì)胞封裝在單個(gè)液滴中。在每個(gè)納升級(jí)的液滴中,細(xì)胞經(jīng)過逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA,其中單個(gè)細(xì)胞的所有cDNA都帶有共同的10x條形碼。




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      測序


      第2步所生成的10x條形碼文庫與Illumina測序儀上的標(biāo)準(zhǔn)短讀長NGS測序兼容,能夠?qū)崿F(xiàn)數(shù)千個(gè)單細(xì)胞的大規(guī)模轉(zhuǎn)錄分析。


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      數(shù)據(jù)分析


      我們的Cell Ranger分析軟件可生成每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)譜,鑒定表達(dá)譜相似的細(xì)胞簇,還能夠?qū)Χ鄠€(gè)樣本的數(shù)據(jù)進(jìn)行合并分析。


      分析流程輸出

      輸出結(jié)果包括質(zhì)控信息和文件,這些文件可輕松用于Loupe可視化軟件或第三方R工具及Python工具的進(jìn)一步分析。



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      數(shù)據(jù)可視化


      利用我們的Loupe Browser可視化軟件,您可以交互式地探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果,研究目的基因的表達(dá)模式,確定細(xì)胞類型,并開展細(xì)胞簇和樣本之間的比較分析。


      只有生物信息專家才能使用嗎?

      Loupe是點(diǎn)選式軟件,任何人都可以輕松下載和使用。






      常 見 問 題

      • Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)能夠?qū)崿F(xiàn)哪種分析?

        它提供了一種全面的方法,來分析基因表達(dá)(全轉(zhuǎn)錄組或靶向),以及細(xì)胞表面蛋白或CRISPR編輯對復(fù)雜生物學(xué)的多維見解。

      • 能夠分析哪些類型的RNA?

        只要是表達(dá)聚腺苷酸化mRNA分子的細(xì)胞類型,都與該單細(xì)胞RNA-seq流程兼容。

      • 與哪些類型的樣本兼容?

        Chromium單細(xì)胞基因表達(dá)與新鮮、固定(甲醇)和冷凍的單細(xì)胞或單細(xì)胞核懸液兼容。兼容的物種包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。

      • 如何分析我的單細(xì)胞數(shù)據(jù)?

        10x Genomics提供了兩種類型的軟件,可幫助您分析數(shù)據(jù):Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger這款分析軟件能夠自動(dòng)生成每個(gè)細(xì)胞的表達(dá)譜,并鑒定表達(dá)譜相似的細(xì)胞簇。隨后,您可以利用Loupe Browser可視化軟件來交互式地探索實(shí)驗(yàn)結(jié)果。您可以從10x支持網(wǎng)站上免費(fèi)下載Cell Ranger和Loupe Browser。

      • 細(xì)胞大小是否存在限制?

        我們在內(nèi)部測試了直徑達(dá)到30微米的細(xì)胞。此外,許多客戶文獻(xiàn)也成功證明了對各類細(xì)胞的兼容性,如肝細(xì)胞、成纖維細(xì)胞和心肌細(xì)胞,它們的大小往往超過30微米。


      相 關(guān) 產(chǎn) 品


        產(chǎn)品


       單細(xì)胞基因表達(dá)


       

         單細(xì)胞免疫分析

       

         空間基因表達(dá)

       

         單細(xì)胞ATAC

        性能
      •   3’轉(zhuǎn)錄組基因在組織中的表達(dá)

      •   靶向基因表達(dá)

      •   多樣本混合檢測

      •   全長配對的TCR/BCR序列

      •   5’全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)

      •   靶向基因表達(dá)

      •   3’轉(zhuǎn)錄組基因在組織中的表達(dá)

      •   靶向基因表達(dá)

      •   兼容FFPE組織切片和新鮮冷凍組織切片

      •   通過開放染色質(zhì)分析進(jìn)行表觀基因組學(xué)研究

        擴(kuò)展應(yīng)用
      •   細(xì)胞表面蛋白

      •   CRISPR篩選

      •   多樣本混合檢測

      •   細(xì)胞表面蛋白

      •   抗原特異性

      •   CRISPR篩選

      •   免疫熒光蛋白共檢測

      •   –

        儀器
      •   Chromium X系列單細(xì)胞系統(tǒng)

      •   Chromium Controller

      •   Chromium Connect

      •   Chromium X系列單細(xì)胞系統(tǒng)

      •   Chromium Controller

      •   Chromium Connect

      •    Visium CytAssist

      •   Chromium X系列單細(xì)胞系統(tǒng)

      •   Chromium Controller

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      友情鏈接:      10x Genomics官網(wǎng)                    10x單細(xì)胞基因表達(dá)                     10x技術(shù)支持                     10x視頻中心

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